CRISPR文库筛选

2023-03-26

实验简介

   利用CRISPR/Cas9技术建立哺乳动物全基因组突变库或者与某类功能相关的基因突变体库,通过功能性筛选和富集以及随后的PCR扩增和深度测序分析,发掘与筛选表型相关的基因,称为CRISPR/Cas9文库筛选。

实验流程

服务内容

      (1) Cas9稳转细胞株的构建

      (2) sgRNA设计合成或者GeCKO v2双质粒系统sgRNA文库扩增

      (3) sgRNA慢病毒文库制备及滴度测定

      (4) sgRNA慢病毒文库转染

      (5) 单基因突变细胞群落筛选

      (6) 药物处理

      (7) 对照组和加药组基因组提取

      (8) 测序文库构建

      (9) sgRNA富集分析(MaGeCKFlute工具箱分析)

      (10) 结题报告撰写

应用实例

基因差异分析:

 

差异性分析结果显示,成功鉴定出筛选基因,筛选信噪比良好。

 

客户提供

细胞名称、筛选指标、全基因组或者某个通路

交付标准

详细的结题报告、筛选到功能基因

 

 

 

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